Evaluación de protocolo para la identificación de bacterias promotoras del crecimiento vegetal mediante el análisis del gen ARN ribosomal 16S con la técnica PCR-RFLP

Abstract

Los métodos de identificación bacteriana han representado una necesidad primaria transversal a diversas áreas del desarrollo humano como la medicina (diagnóstico hospitalario, enfermedades nosocomiales), Biología (filogenia y ecología microbiana), agricultura (Bio-fertilizantes, biopesticidas), inocuidad alimentaria (patógenos en los alimentos), farmacología (Producción de antibióticos y actividad antimicrobiana de fármacos), entre otros. Entre los métodos mayormente utilizados se encuentran la identificación bacteriana por métodos tradicionales, fenotípicos y genotípicos. Este último consta de diferentes técnicas que, muchas veces, utilizan tecnologías avanzadas de alto costo. No obstante, existen técnicas genotípicas más accesibles para los laboratorios, las cuales requieren de equipos básicos comúnmente encontrados en investigación. El análisis de los polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (PCR-RFLP) pertenece a los métodos basados en la genotipificación por restricción del ADN. Consta del análisis de un gen conservado (reloj molecular) mediante su escisión con endonucleasas, generando perfiles de digestión diferenciales. Normalmente, la técnica es utilizada para diagnosticar la presencia de bacterias de interés particular en una muestra ambiental, sin embargo, no está muy descrita su utilización para la identificación inferencial de bacterias ambientales. El presente estudio pretende evaluar la técnica PCR-RFLP para la identificación de bacterias promotoras del crecimiento vegetal por medio del análisis del ARN ribosomal 16S.