Evaluation of bacterial DNA extraction methods in fecal samples of patients diagnosed with Helicobacter pylori infection
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The identification of microorganisms through molecular techniques has become very popular in recent years due to their accuracy. The Polymerase Chain Reaction (PCR) is a molecular diagnostic technique highly valued for its rapidity of results, high sensitivity and specificity, however, the performance of this technique depends on the quality of the extracted DNA. Fecal samples contain a large number of substances, such as salts that may behave as inhibitors for the PCR, for this reason, this study evaluated some modifications to bacterial DNA extraction techniques of the phenol-chloroform methodology in 10 fecal samples taken from patients diagnosed with infection by Helicobacter pylori in the Department of Atlántico, Colombia. In the final method an average DNA concentration of 1,501.0 ng/μl was obtained.
La identificación de microorganismos a través de técnicas moleculares ha tomado gran popularidad en los últimos años gracias a su precisión. La Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) es una técnica de diagnóstico molecular sumamente valorada por su rapidez de resultados, alta sensibilidad y especificidad, sin embargo, el rendimiento de esta técnica dependerá de la calidad del ADN extraído. Las muestras fecales contienen una gran cantidad de sustancias, como sales que pueden comportarse como inhibidores para la PCR, por esta razón, se llevó a cabo este estudio donde se evaluaron algunas modificaciones a técnicas de extracción de ADN bacteriano por medio de la metodología fenol-cloroformo en 10 muestras fecales tomadas de pacientes diagnosticados con infección por Helicobacter pylori en el departamento del Atlántico. En el método final se obtuvo una concentración promedio de ADN de 1.501,0 ng/µl.
La identificación de microorganismos a través de técnicas moleculares ha tomado gran popularidad en los últimos años gracias a su precisión. La Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) es una técnica de diagnóstico molecular sumamente valorada por su rapidez de resultados, alta sensibilidad y especificidad, sin embargo, el rendimiento de esta técnica dependerá de la calidad del ADN extraído. Las muestras fecales contienen una gran cantidad de sustancias, como sales que pueden comportarse como inhibidores para la PCR, por esta razón, se llevó a cabo este estudio donde se evaluaron algunas modificaciones a técnicas de extracción de ADN bacteriano por medio de la metodología fenol-cloroformo en 10 muestras fecales tomadas de pacientes diagnosticados con infección por Helicobacter pylori en el departamento del Atlántico. En el método final se obtuvo una concentración promedio de ADN de 1.501,0 ng/µl.
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