La bioinformática como herramienta para el conocimiento de microorganismos edáficos con potencial para la producción agrícola sostenible, recuperación y conservación de suelos

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dc.contributor.advisorBarraza Amador, Beatriz Cecilia
dc.contributor.advisorTeherán Sierra, Luis Guillermo
dc.contributor.authorÁngel Gaviria, Isidro José
dc.coverage.spatialBarranquillaspa
dc.creator.emailangelgaviria38@hotmail.comspa
dc.date.accessioned2024-04-04T21:23:31Z
dc.date.available2024-04-04T21:23:31Z
dc.date.created2023
dc.description.abstractLas herramientas bioinformáticas se han consolidado como la tecnología vanguardista con un uso cada vez más frecuente en áreas profesionales de especialidades clínicas, ambientales y agropecuarias, para esta última, las herramientas bioinformáticas son necesarias para una representación completa de microorganismos benéficos en suelos destinados para cultivo, entre otros usos. En la presente investigación se realizó una revisión tipo documental de investigaciones científicas que utilizaron herramientas bioinformáticas algunas de las cuales fueron (QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology), Mothur, UPARSE y Usearch), con el propósito de identificar y caracterizar microorganismos del suelo. La revisión documental, arrojó como resultado la existencia en la actualidad de una gran variedad de programas y técnicas que permiten la obtención de información de microorganismos en diferentes tipos de suelo y climas que luego se identificaron mediante bases de datos especializadas como GenBank, EMBL-EBI, DDBJ, entre otras; encontrándose principalmente microorganismos de diferentes especies pertenecientes a las Actinobacterias, Acidobacterias y Gammaproteobacterias, las cuales cumplen un papel importante en la salud de los suelos. Este trabajo ha sido pensado como documento de consulta base para futuras investigaciones en el campo de la agricultura, en donde se necesite conocer qué tipo de microorganismos benéficos para cultivos existen en los suelos de las áreas de estudio y qué herramientas bioinformáticas de las más usadas hoy en día, son las mejores para caracterizarlos e identificarlos.spa
dc.description.abstractenglishBioinformatics tools have become a cutting-edge technology increasingly used in professional areas such as clinical, environmental, and agricultural specialties. In the latter, bioinformatics tools are essential for a comprehensive representation of beneficial microorganisms in cultivated soils, among other uses. In this research, a documentary review of scientific investigations that used bioinformatics tools was conducted, some of which included QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology), Mothur, UPARSE, and Usearch, with the purpose of identifying and characterizing soil microorganisms. The documentary review revealed the existence of a wide variety of programs and techniques that allow the acquisition of information on microorganisms in different types of soil and climates, which were then identified using specialized databases such as GenBank, EMBL-EBI, DDBJ, among others. Mainly, microorganisms from different species belonging to Actinobacteria, Acidobacteria, and Gammaproteobacteria were found, which play an important role in soil health. This work has been conceived as a basic reference document for future research in the field of agriculture, where it is necessary to know what type of beneficial microorganisms for crops exist in the soils of the study areas and which bioinformatics tools, among the most used today, are the best for characterizing and identifying them.spa
dc.description.sponsorshipUniversidad Libre Seccional Barranquilla -- Facultad de Ciencias Exactas y Naturales -- Maestría en Biotecnologíaspa
dc.formatPDFspa
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10901/28824
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dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa
dc.rights.licenseAtribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombiaspa
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/spa
dc.subjectHerramientas bioinformáticasspa
dc.subjectCultivosspa
dc.subjectSuelosspa
dc.subjectMicroorganismos benéficosspa
dc.subject.lembMicrobiología agrícolaspa
dc.subject.lembMicroorganismos de suelosspa
dc.subject.lembSuelospa
dc.subject.lembBioinformáticaspa
dc.subject.subjectenglishBioinformatics toolsspa
dc.subject.subjectenglishCropsspa
dc.subject.subjectenglishSoilsspa
dc.subject.subjectenglishBeneficial microorganismsspa
dc.titleLa bioinformática como herramienta para el conocimiento de microorganismos edáficos con potencial para la producción agrícola sostenible, recuperación y conservación de suelosspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/masterThesisspa
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionspa
dc.type.localTesis de Maestríaspa

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