Respiratory viruses identified from hospitalized patients in an institution of higher complexity
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Universidad Libre
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Introduction: Acute Respiratory Infections (ARI) are a group of diseases with respiratory symptoms similar caused by bacteria or viruses that are acquired by direct contact or through the air.
Objective: To determine the prevalence of detected respiratory viruses by using the test CLART PneumoVir in Fundación Valle del Lili since June 2013 to December 2014.
Methods: A cross sectional study was conducted, in patients admitted to a general hospital between June 2013 to December 2014. Samples were analysed through multiplex RT- PCR and detection by microarrays. Descripitve statitics were used.
Results: Of 161 samples, 96 (60%) were positive. Isolation of viruses was higher in ICU patients (56%). 32 % of positive yields came from patients 60 years of age and older. The viruses most frequently detected were Rhinovirus (30%), Influenza (H1N1/2009) (12%) and Bocavirus (12%). Influenza A (H1N1/2009) was the most commonly isolated strain among Influenza viruses (12%), followed by 11% (17 cases) with viral coinfection. No seasonal pattern was identified. All patients received antibiotics.
Conclusion: The multiplex RT-PCR and detection by microarray are a tool useful, sensitive and faster for identification of virus circulation mayor in the world. Unlike what was reported in the scientific literature, this study mayor percentage of positive tests in adults was observed seasonality was observed and no para none evaluated the virus.
Introducción: Las Infecciones Respiratorias Agudas (IRA) son un grupo de enfermedades con sintomatología respiratoria similar, causadas por bacterias o virus que se adquieren por contacto directo o a través del aire. Objetivo: Determinar la prevalencia de virus respiratorios identificados por RT-PCR múltiplex y detección por microarreglos, en la Fundación Valle del Lili entre junio de 2013 y diciembre de 2014. Métodos: Realizamos un estudio observacional descriptivo de corte transversal, se evaluaron registros de pacientes hospitalizados en la FVL entre junio de 2013 y diciembre de 2014. Las muestras fueron evaluadas por RT-PCR múltiplex y detección por microarreglos (CLART PneumoVir), se aplicó estadística descriptiva. Resultados: De 161 muestras, 96 (60 %) fueron positivas. El servicio con la mayor proporción de pacientes positivos fue la Unidad de Cuidados Intensivos-UCI (56%). El 32 % de los aislamientos positivos se identificaron en pacientes mayores de 60 años. Los virus más frecuentemente detectados fueron: Rinovirus (30%), Influenza (H1N1/ 2009) (12 %) y Bocavirus (12 %). Influenza A (H1N1/2009) fue la cepa más comúnmente aislada entre los virus de la gripe (12%), seguido de un 11% (17 casos) con coinfección viral. No se identificó el patrón estacional. Conclusión: La RT-PCR múltiplex y la detección por microarreglos para la identificación de los virus de mayor circulación en el mundo, son herramientas útiles, sensibles y rápidas. A diferencia de lo reportado por la literatura científica, en este estudio se observó mayor porcentaje de pruebas positivas en adultos y no se observó estacionalidad para ninguno de los virus evaluados
Introducción: Las Infecciones Respiratorias Agudas (IRA) son un grupo de enfermedades con sintomatología respiratoria similar, causadas por bacterias o virus que se adquieren por contacto directo o a través del aire. Objetivo: Determinar la prevalencia de virus respiratorios identificados por RT-PCR múltiplex y detección por microarreglos, en la Fundación Valle del Lili entre junio de 2013 y diciembre de 2014. Métodos: Realizamos un estudio observacional descriptivo de corte transversal, se evaluaron registros de pacientes hospitalizados en la FVL entre junio de 2013 y diciembre de 2014. Las muestras fueron evaluadas por RT-PCR múltiplex y detección por microarreglos (CLART PneumoVir), se aplicó estadística descriptiva. Resultados: De 161 muestras, 96 (60 %) fueron positivas. El servicio con la mayor proporción de pacientes positivos fue la Unidad de Cuidados Intensivos-UCI (56%). El 32 % de los aislamientos positivos se identificaron en pacientes mayores de 60 años. Los virus más frecuentemente detectados fueron: Rinovirus (30%), Influenza (H1N1/ 2009) (12 %) y Bocavirus (12 %). Influenza A (H1N1/2009) fue la cepa más comúnmente aislada entre los virus de la gripe (12%), seguido de un 11% (17 casos) con coinfección viral. No se identificó el patrón estacional. Conclusión: La RT-PCR múltiplex y la detección por microarreglos para la identificación de los virus de mayor circulación en el mundo, son herramientas útiles, sensibles y rápidas. A diferencia de lo reportado por la literatura científica, en este estudio se observó mayor porcentaje de pruebas positivas en adultos y no se observó estacionalidad para ninguno de los virus evaluados
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