Microbiología
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Item type:Ítem, Análisis in silico de genes vinculados a la biosíntesis de ácido indolacético (AIA) asociados a aislamientos bacterianos de suelos agrícolas del Eje CafeteroJaramillo Zárate, María José; Rivera Rodríguez, SilviaEl ácido indolacético (AIA) es una de las principales fitohormonas responsables de la morfogénesis de las plantas y un metabolito secundario bacteriano de interés en las Bacterias Promotoras de Crecimiento Vegetal (BPCV). En las aplicaciones biotecnológicas que se dan en la agricultura, como la formulación de bioinsumos, se requiere de una caracterización amplia y detallada de las propiedades y mecanismos con los que el microorganismo puede impactar positivamente la planta y/o el entorno de esta. No obstante, la biosíntesis del AIA en BPCV no cuenta con una exploración amplia, y la bioinformática representa una herramienta valiosa para develar información sobre este metabolismo de forma integral. En esta investigación se realizó el análisis bioinformático de los cinco morfotipos con mayor producción de AIA dentro del proyecto “Biotecnología Agrícola para Producción de Hortalizas en Risaralda” (Bueno-López, 2023) a partir de las secuencias ARNr 16S y sus genomas homólogos, para comprobar las bases genéticas y moleculares de este proceso metabólico, en conjunto con propiedades genómicas que justifican su potencialidad para procesos biotecnológicos. Se demuestra que las especies homólogas son pertenecientes de Pseudomonas, Burkholderia y Bacillus, géneros relevantes en las BPCV. Se determinó la existencia de los genes para dos rutas biosintéticas dependientes de TRP y cómo su filiación a un mismo grupo de genes homólogos, clusters y relaciones filogenéticas se constituyen desde las regiones conservadas en los genomas de Pseudomonas y Burkholderia, y del enfoque de investigación del AIA para estos dos géneros. Se encuentra que la producción de AIA in vitro en BPCV suele estar asociada a otras actividades promotoras de crecimiento vegetal que suman a la respuesta de la planta hacia el estrés ambiental. Este estudio termina sumándole valor agregado a los candidatos para la propuesta de formulación de un bioinsumo, y destaca la importancia de la aplicación de herramientas in silico en pro del desarrollo agrícola y de los contextos de investigación desde la academia.Item type:Ítem, Aprovechamiento de subproductos agroindustriales (pectina y queratina) en la fabricación de películas comestibles para la protección al deterioro de frutos en fresaVélez García, Juan David; Jimenez Sanchez, Isabella; Gaviria Arias, Duverney; Navia Morocho, Heidy CatalinaEl crecimiento agroindustrial ha traído consigo el consumo global de diferentes alimentos, lo que implica un envasado óptimo para conservar su calidad mientras llegan a su destino. Este proceso desarrolla un papel esencial en la reducción del desperdicio de alimentos extendiendo su vida útil. Sin embargo, es una actividad que implica un uso desbordante de plásticos que terminan contaminando los océanos; por esto resulta importante desarrollar alternativas biodegradables como los empaquetamientos comestibles. Se propone desarrollar biopelículas comestibles a partir de subproductos agroindustriales, pectina obtenida de las cascaras del fruto del maracuyá y queratina extraída de plumas de gallinas, los cuales están implicados en el desarrollo de biopelículas para recubrir las fresas y aumentar su vida útil, también se llevará a cabo la caracterización fisicoquímica y microbiológica y se evaluarán las mejores características de conservación. Como resultado se realizó el recubrimiento de frutos de fresas a partir de pectina, queratina y la mezcla de estos biomateriales obteniendo resultados notablemente diferentes en cada uno de los ensayos.Item type:Ítem, caracterización de actividad promotora de crecimiento vegetal en bacterias aisladas de la compostera de la Universidad Libre seccional PereiraRosero Realpe, Mateo; Giraldo Parra, Natalia; Arias Gaviria, DuverneyEl cultivo de hortalizas es altamente promisorio en Colombia, pero se requiere mayor conocimiento de su manejo agronómico y de los microorganismos que crecen asociados a su rizosfera, de los cuales dependen estas plantas para su nutrición y crecimiento. En este trabajo se aislaron e identificaron de un compost de la Universidad Libre de Pereira las bacterias promotoras de crecimiento como fijación de nitrógeno, solubilización de fosfato y potasio por medio de unos agares que indican la presencia de esta actividad en cada una de ellas, seleccionando las de mejor actividad; posteriormente se llevó a cabo las compatibilidades para evaluar que bacterias se llevan bien con las otras para el trabajo en equipo, eligiéndose solo las que no generan inhibición. Para establecer cuál es el grupo adecuado se formuló cinco insumos con las bacterias seleccionadas según su crecimiento y su trabajo en equipo, ensayándose en una plántula de frijol para así establecer los cambios que se presentaron en su crecimiento y desarrollo.Item type:Ítem, Evaluación in vitro del efecto antimicrobiano a escherichia coli por bacterias ácido lácticas provenientes de queso fresco de la región cafetera de ColombiaVargas Castrillón, Juan David; Vergara Uribe, Valentina; Siller López, Fernando RafaelLos quesos frescos son un alimento sumamente propenso a la contaminación por diversos microorganismos ya que este presenta una microbiota alta debido a la leche cruda pues esta no pasa por un proceso de pasteurización previo para la elaboración del queso, por ello este proceso requiere de una total inocuidad para su elaboración y conservación. Las bacterias acido lácticas son fermentadoras y productoras del ácido láctico, el cual es muy empleado en la industria para brindarle a algunos alimentos unas características y protegerlos contra la acción de otros microorganismos patógenos. La presente investigación tuvo como objetivo la identificación de la capacidad de inhibición del crecimiento de E. coli en queso fresco por la presencia de bacterias acido lácticas (BAL). La muestra de queso fresco fue obtenida de una quesera cuya leche provenía del municipio de Santa Rosa de Cabal, el análisis microbiológico fue realizado mediante una técnica de antagonismo para evaluar la capacidad de inhibición in vitro de BAL frente a E. coli, también se usaron técnicas moleculares para la caracterización del microbioma entre ellas PCR, cuantificación y secuenciación. Para la obtención de todos los resultados se tuvieron algunos inconvenientes ya que se terminó el semestre y por falta de tiempo no se pudieron observar los resultados hasta donde se tenían así que iniciando el siguiente semestre se realiza nuevamente el estudio, en el segundo ensayo pudimos avanzar un poco más logrando identificar la presencia de bacterias ácido lácticas en un queso fresco de la región, se evidenció que si hubo un efecto de inhibición de las BAL frente al crecimiento de E. coli se logró obtener la pureza de un ADN, una PCR positiva con un tamaño que va desde 1.3 a 1.5 kb; por otra parte, la prueba in vivo de inhibición, la caracterización molecular, la amplificación de PCR y la electroforesis no fue posible su realización por causas de la pandemia del COVID-19.Item type:Ítem, Comparación de diferentes metodologías de siembra y zonas de toma de muestra gástrica para la detección de Helicobacter pylori por cultivo en pacientes que asisten a endoscopia de las ciudades de Pereira y ManizalesRamírez Osorio, Catalina; Ospina Joaqui, Wendy L.; Álvarez Aldana, AdalucyEste estudio pretende determinar si las tasas de recuperación de la bacteria en el cultivo son diferentes con respecto a la zona de la mucosa gástrica utilizada (antro, cuerpo, fondo) o cuando la metodología de procesamiento de la muestra es diferente (impresión, maceración).Item type:Ítem, Evaluación y formulación de microorganismos eficaces para el tratamiento de aguas residuales generadas en una industria porcícola del municipio de Pereira, Risaralda(Universidad Libre Seccional Pereira, 2017-03-21) Izquierdo Cardona, Julián Esteban; Montealegre Palma, Oscar Javier; Muñoz Tobón, EliorLa técnica de los microorganismos eficaces (ME), corresponde al uso de microorganismos foto-tróficas, productores de ácido láctico, levaduras y hongos de fermentación, que tienen ventajas potenciales en tratamientos de aguas residuales y en aceleración de procesos bioquímicos, su potencial metabólico evita la proliferación de baterías patógenas. En el presente estudio, se evaluó la capacidad de reducción de bacterias patogénicas con el fin de mejorar la calidad microbiológica del agua para su vertimiento, se realizaron 3 mezclas de microorganismos eficientes (ME) inoculados en un tratamiento de aguas residuales porcícolas bajo condiciones de laboratorio durante 21 semanas. A través de un monitoreo fisicoquímico (pH y T°) y monitorio microbiológico de enterobacterias, se registró que en la prueba de filtración por membrana se obtuvo una reducción significativa de la carga microbiana durante las semanas 8, 9 y 10 en las mezclas 2 y 3. Además la reducción de turbidez y poca sedimentación, comparado con las mezclas 1.Item type:Ítem, Evaluación del riesgo microbiológico de alimentos expendidos en vía pública en la comuna centro del municipio de Pereira(Universidad Libre Seccional Pereira, 2018-03-21) Chica Londoño, Ana María; Giraldo Rivera, Mariana; Mejía Hurtado, María AlejandraEl presente estudio pretende caracterizar las condiciones higiénicas sanitarias de alimentos de los puestos de venta en vía pública de la comuna centro del municipio de Pereira, describir algunas categorías de interés con observación directa de la infraestructura de los puestos de venta, lavado de manos, lavado de utensilios, acceso al agua, manejo de residuos sólidos y almacenamiento de los alimentos, se realizaron una encuesta de factores de riesgos basada en las prácticas de inocuidad de los vendedores de alimentos en dichos puestos. Para la parte microbiológica se identificaron mesófilos aerobios, mohos y levaduras, Staphylococcus aureus, coliformes totales y fecales y Salmonella spp en muestras de alimentos.Item type:Ítem, Validación del método de número más probable (NMP) para Saphylococcus Aureus Coagulasa positiva en muestras de leche cruda como indicador de calidad(Universidad Libre Seccional Pereira, 2015-05-02) Uribe Palacio, Germán David; López Aguirre, AndreaLos microorganismos indicadores de calidad en leche son utilizados principalmente para determinar el crecimiento de patógenos que puedan afectar la calidad de los productos lácteos, Staphylococcus aureus es utilizado como microorganismo indicador de calidad en leche, ya que puede determinar la presencia de microorganismos patógenos como Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae y Enterobacter aerogenes que disminuyen la calidad de los productos lácteos; causando con ello pérdidas económicas en el sector lechero. Se determinará la presencia de Staphylococcus aureus coagulasa positiva para validar el método de número más probable (NMP) en leche cruda de muestras tomadas de los 14 municipios del departamento de Risaralda.Item type:Ítem, Identificación de trichinella ssp. en porcinos faenados en seis plantas de sacrificio del departamento de Risaralda y validación secundaria del método por digestión enzimática(Universidad Libre Seccional Pereira, 2016-04-16) Holguín Sterling, Laura Cristina; Ángel Vargas, Paula Andrea; Osorio Reina, Nycol; Gil López, Laura KatherineTrichinella spp es un nematodo helminto, del cual se han descubierto varias especies entre las cuales se encuentra T. spirallis responsable de la trichinelosis en humanos;. Su ciclo biológico se realiza en único hospedero, el cual inicia cuando un animal ingiere larvas viables enquistadas, estas se liberan en el intestino delgado, se reproducen sexualmente y luego migran por la sangre o linfa hasta llegar e infectar otros órganos produciendo miocarditis, encefalitis y en algunas ocasiones complicaciones respiratorias.Item type:Ítem, Evaluación y formulación de microorganismos eficaces para el tratamiento de aguas residuales generadas por la industria porcícola en Risaralda(Universidad Libre Seccional Pereira, 2017-08-10) González Algecira, Jhonatan; Arboleda Ocampo, Ana MilenaObjetivos específicos: Caracterizar físico-química y microbiológicamente las aguas residuales de un predio porcícola certificado por el ICA -- Formular diferentes tipos mezclas de microrganismos eficaces (ME) durante el tratamiento de las aguas residuales de esta industria en un predio porcícola certificado por el ica -- Evaluar la eficiencia de las mezclas de micro-organismos estudiadas sobre las características físico-químicas y microbiológicas de las aguas residuales del predio certificado y en estudio -- Identificar las mezclas de micro-organismos más eficientes para recuperar las características físico-químicas y microbiológicas de las aguas residuales del predio certificado en estudio.