Microbiología
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Item type:Ítem, Análisis in silico de genes relacionados con rutas enzimáticas para la solubilización de fosfatos de aislamientos de bacterias de suelos agrícolas del Eje CafeteroToro Vasco, María Manuela; Rivera Rodríguez, Silvia CarolinaEl fósforo (P) es un macronutriente esencial para las plantas y desempeña un papel fundamental en su crecimiento y desarrollo, las bacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPB) son microorganismos que interactúan de manera positiva con las plantas, estimulando su crecimiento y mejorando su resistencia a condiciones adversas, una de sus funciones es la solubilización de fosfato mediante diversos mecanismos como la producción de ácidos orgánicos e inorgánicos y la secreción de enzimas fosfatasa; este estudio se basa de seis secuencias 16S rRNA proporcionadas por el Proyecto “Bio-tecnología Agrícola para producción de hortalizas en Risaralda” donde se busca identificar los genes responsables de la solubilización de fosfatos reportados en la literatura dentro del genoma completo de Bacillus cereus y Pseudomonas oryziphila por su mayor capacidad de solubilizar fosfato mediante la herramienta bioinformática BLAST. Se encontraron en Bacillus cereus los genes phnF, phnE, pstSCA y phoU, en el genoma completo de Pseudomonas oryziphila se encontraron los genes pqqABCDEF y pstSAB, además se demostró mediante dendrogramas que, aunque Bacillus cereus y Pseudomonas oryziphila sean lejanos genéticamente, los genes responsables de la solubilización de fosfato están relacionados genéticamente, lo que puede demostrar similitudes funcionales. En conclusión, los hallazgos destacan el potencial significativo de especies como Bacillus cereus y Pseudomonas oryziphila en la promoción del crecimiento vegetal y su utilidad como componentes clave en bioinsumos agrícolas.Item type:Ítem, Exploración de bacterias degradadoras de celulosa y almidón en residuos vegetales de la Tienda Ananá, Universidad Libre – PereiraTorres Garcia, Andrea; Monsalve Gomez, Jhon Sebastian; Londoño Giraldo, Lina MariaEl manejo ineficiente de los residuos sólidos orgánicos (RSO) representa una amenaza significativa para los ecosistemas y la salud pública, provocando alteraciones en los ciclos biogeoquímicos, contaminación de recursos hídricos y atmosféricos, y degradación de la calidad de vida en entornos urbanos y rurales. Este estudio se enfoca en una exploración de la presencia de bacterias con capacidad degradadora de celulosa y almidón en los residuos orgánicos generados por la Tienda Ananá de la Universidad Libre, Seccional Pereira. Se empleó un enfoque metodológico basado en técnicas de aislamiento microbiológico selectivo, utilizando medios de cultivo específicos (agar carboximetilcelulosa y agar almidón) para la identificación de los aislamientos con actividades celulolíticas y amilolíticas, respectivamente. La caracterización fenotípica se realizó mediante análisis morfológicos y pruebas bioquímicas básicas (tinción de Gram, catalasa y oxidasa). La actividad enzimática se evaluó cualitativamente mediante la formación de halos de hidrólisis, visualizados con tinciones específicas. Los resultados revelaron una prevalencia relativamente baja de bacterias con capacidades degradadoras específicas: de aislamientos en agar CMC, solo una (6.25%) exhibió actividad celulolítica significativa, mientras que de 24 aislamientos en agar almidón, siete (29.17%) demostraron actividad amilolítica. La caracterización fenotípica sugiere la presencia de géneros potencialmente involucrados en estos procesos degradativos, incluyendo Micrococcus, Microbispora, Streptomyces, Acinetobacter, Streptococcus y Enterococcus, aunque se requiere confirmación molecular para una identificación taxonómica precisa. La baja frecuencia de aislamientos con actividades degradadoras específicas podría atribuirse a factores como la composición particular de los residuos estudiados, las condiciones ambientales locales, o la competencia microbiana por diversas fuentes de carbono disponibles. Este estudio establece una base para investigaciones futuras sobre la ecología microbiana en RSU y su posible aplicación en estrategias de biorremediación y aprovechamiento de residuos. Se recomienda para futuros estudios realizar mayor cantidad de pruebas bioquímicas e incluso identificación a nivel molecular para llegar a clasificar estos microorganismos a nivel de género y especie con alta confiabilidad.Item type:Ítem, Aplicaciones biotecnológicas de las algas a nivel mundial: análisis bibliométrico 1947-2022Abril Torres, Karen Daniela; Alvarez Aldana, Adalucy; Gaviria, Duverney; Londoño Giraldo, Lina MSe construyó una base de datos bibliográfica con 5.012 documentos extraídos de Scopus, la cual rastrea el surgimiento y la evolución en la investigación de las aplicaciones biotecnológicas de las algas desde el año 1947 hasta el 2022 alrededor del mundo. Este documento proporciona una revisión actualizada de los datos más relevantes en cuanto a autores, países, revistas, instituciones y artículos, mediante el uso de los softwares Bibliometrix y VOSviewer. Además, se identifican las principales corrientes de investigación de las aplicaciones biotecnológicas de las algas, resaltando su importancia en diferentes disciplinas.Item type:Ítem, Construcción de una pila de combustible microbiano (PCM) alimentada a partir de diferentes tipos de subproductos agroindustriales.Acero Páez, Laura Andrea; Gaviria Arias, DuverneyLas Pilas de Combustible Microbianas (PCM) es una tecnología que puede aprovechar el poder de los microbios para la producción de energía sostenible a partir de elementos orgánicos. La PCM que se desarrolló utilizó sedimentos acuáticos en conjunto con subproductos agroindustriales (cereza de café y bagazo de caña de azúcar), se establecieron los parámetros fisicoquímicos para obtener la mayor tensión, corriente y descarga de electrones en esta se midió con ayudad de un multímetro digital de rango automático. El objetivo de esta investigación fue construir una pila de combustible microbiano alimentada con diferentes tipos de subproductos agroindustriales. A nivel microbiológico se identificó la comunidad microbiana que se encuentra en los sedimentos encargada de la generación de energía. A partir de los resultados obtenidos hasta el momento se verifica el gran potencial de la estrategia propuesta ya que con el uso de 1 Kg de sedimentos acuáticos y la adición de 300 g de glucosa se obtuvo una diferencia de potencial de 500 mV en tan solo 5 días; el ensayo con sacarosa se evaluó por 31 días y llego a producir 328 mV; al realizar la comparación entre los subproductos agroindustriales: el bagazo de caña pasados los 63 días obtuvo un potencial energético en promedio de 168,3 mV, mientras que la cereza de café durante 44 días genero diariamente 270,2 mV. Finalmente, a partir de los resultados obtenidos se estableció la cereza de café con el mejor sustrato para la creación de una PCM portátil la cual consta de 2 cámaras cada una de 5 litros unificadas con 3 puentes salinos posicionados de manera horizontal.Item type:Ítem, Aislamiento y caracterización de aislados del género Bacillus spp. con potencialidades de bioestimulación del crecimiento vegetal de cultivos de plátanoGaviria Díaz, Camila Andrea; Bueno López, Liliana; Buriticá, Héctor MarioEn la actualidad, las comunidades microbianas promotoras del crecimiento vegetal han sido el foco de estudios destinados a entender su papel como mejoradores de crecimiento vegetal y su implicación en la salud de la planta. Se han identificado diferentes especies de bacterias que colonizan tejidos de las plantas, desde las raíces hasta el tallo, las hojas y demás. Este proyecto pretende contribuir al conocimiento sobre el uso de MPCV con el objetivo de disminuir el uso de fertilizantes químicos que, además de representar una fuente creciente de contaminación no solo por uso sino por su fabricación, incrementan los costes de producción de cultivos. Todo esto través del abordaje de una metodología de aislamiento basada en la caracterización bioquímica y morfológica, para determinar la presencia de bacterias perteneciente al género de Bacillus spp., que pueden representar importancia en el crecimiento y desarrollo de plantas de plátano; se intenta tener un primer acercamiento a la diferenciación de especies y evaluar sus posibles efectos promotores de crecimiento vegetal.Item type:Ítem, Revisión: Efecto de abonos orgánicos en las propiedades microbiológicas y químicas del suelo, y sobre crecimiento de plantas de plátano (musa AAB)Sánchez López, Juan David; Villanueva Fernández, Juan David; -, -Mediante búsquedas de artículos en bases de datos como ScienceDirect, Scopus, Scielo y también Google académico, con términos de búsqueda y palabras clave tales como: abonos orgánicos, suelos, microorganismos eficientes, características del suelo, análisis fisicoquímico del suelo, Fusarium spp y Musa AAB. Haremos una indagación metodológica para hacer la revisión de tema y así poder concluir y saber qué métodos son de gran ayuda en el ámbito de agricultura y la agroindustria gracias a la acción de microorganismos y qué reacciones físicas y químicas tienen los suelos con los abonos orgánicos.Item type:Ítem, Evaluación de la implementación de un sistema de biorremediación en la quebrada “la Mielita”López Posada, Valery Geraldine; Sepúlveda Casallas, Isabella; Gaviria Arias, DuverneyLa contaminación hace inviable suplir la demanda de agua en todas sus funciones y su recuperación natural, por lo que se debe buscar sistemas de remediación con técnicas especificas a factores intrínsecos y extrínsecos propios del ambiente y sus problemáticas directas (Ossai et al. 2020), la biorremediación es una solución económica que aprovecha factores propios del ambiente y recursos biotecnológicos que no impacten negativamente en el equilibrio ambiental usando microorganismos nativos o adaptados para la descomposición de contaminantes (Adams et al. 2015) que simultáneamente con la prevención logre mejoras en la cantidad y calidad del agua que se encuentra superficialmente y sistemas directa e indirectamente dependientes a este recurso.Item type:Ítem, Multiplicación de Streptomyces sp. con propósitos de biocompostaje de subproductos de caña de azúcar(Universidad Libre Seccional Pereira, 2019-03-21) Lemus Angulo, John AndrésCon propósitos de biocompostaje, mediante el presente trabajo de investigación se realizó el aislamiento del Actinomycete Streptomyces sp., a partir de un nicho ecológico, para lo cual se tomaron muestras de suelo, a 10 cm de profundidad; las muestras se llevaron a laboratorio en bolsas ziploc®; luego se homogenizaron y seguidamente se realizaron las diluciones propuestas, de las cuales se inocularon las 10-6, 10-7 y 10-8; estas siembras se llevaron a cabo en medio de cultivo Agar avena y permanecieron en condiciones de temperatura ambiente del laboratorio. Una vez aislada la cepa de interés, con características de Streptomyces sp., se iniciaron repiques en los medios de cultivo Ashby, GYM y Murashige and Skooge (MS), con el propósito de evaluar el crecimiento del microorganismo hasta obtener una cepa pura; el mejor resultado se presentó en el medio solido GYM. Posteriormente se realizaron siembras en los mismos medios, pero en condición líquida, para evaluar la capacidad de multiplicación de Streptomyces en medio líquido; los medios líquidos Ashby y MS no representaron buenas condiciones para la multiplicación de Streptomyces; el medio de cultivo líquido GYM registró los mejores resultados para la multiplicación de Streptomyces; además, dicho medio se evaluó con presencia/ausencia de CaCO3 (carbonato de calcio); gran importancia exhibió la presencia de esta sustancia en el medio, ya que registró menor presencia de microorganismos indeseables, por lo que fue elegido para realizar la multiplicación masiva de Streptomyces en condición líquida, con fines de inoculación en procesos de biocompostaje de subproductos de la caña de azúcar.Item type:Ítem, Evaluación del efecto inhibitorio de extractos obtenidos de bacterias acido lácticas (BAL) frente al crecimiento de Salmonella spp(Universidad Libre Seccional Pereira, 2018-03-21) Cortés Duque, Juan Camilo; Mejía Rivera, Luisa Fernanda; Oyola Vanegas, Yuli FabianaSe vio la necesidad de evaluar la actividad antimicrobiana de los péptidos sintetizados por las BAL en el crecimiento de Salmonella spp; para establecer futuras aplicaciones con base en el aprovechamiento de la capacidad inhibitoria para el diseño de productos biotecnológicos dirigidos al mejoramiento de la calidad sanitaria del queso fresco. En este ensayo, se tomaron 50 muestras seleccionando en total 98 cepas. Las cepas seleccionadas ya contaban con la caracterización previamente realizada a partir de la realización de un cultivo bacteriológico y confirmación molecular por PCR; a partir de los microorganismos proporcionadas por el banco de cepas, se realizaron dos protocolos: El protocolo inicial consistió en la reactivación de las cepas, se procedió a centrifugar y filtrar. El segundo protocolo consistió en activar las bacterias ácido lácticas, se centrifugó, se filtró, en tubos eppendorf con sulfato de amonio ((NH4)2SO4) al 80% de saturación, luego se incubó con agitación durante tres horas, se centrifugó nuevamente a 14.000 rpm durante 20 minutos, se decantó el sobrenadante y se resuspendió en 100 µl de H2O. Se preparó el inoculo (Salmonella spp) a N° 0,5 en la escala de Mcfarland para agregarse al medio de cultivo microbiológico Mueller Hinton, se sirvió en placa y finalmente se realizó perforaciones formando pozos para agregar los extractos obtenidos de los protocolos propuestos. Los resultados alcanzados en la evaluación de la actividad inhibitoria presentada por los extractos obtenidos de las bacterias ácido lácticas, mostró actividad antimicrobiana negativa para la inhibición del patógeno evaluado Salmonella spp. debido a factores moleculares, factores filogenéticos y demás, que la diferencia de las bacterias Gram-positivas.Item type:Ítem, Aproximación al diagnóstico de la calidad de agua de la quebrada La Mielita en la Universidad Libre seccional Pereira(Universidad Libre Seccional Pereira, 2018-03-21) Corredor Ortega, Daniela; Bedoya Gutiérrez, Luisa FernandaLa quebrada la Mielita hace parte de la subcuenca del río Consota, la cual recorre áreas urbanas tales como: El Dorado, Normandía, Avenida de las Américas y el Barrio Cuba, son las fuentes que abastecen el acueducto del área urbana del municipio de Pereira. Para el monitoreo del agua de la quebrada se establecieron tres puntos de muestreo, buscando con esto, tener una aproximación al diagnóstico de la de la calidad de agua en la quebrada, como punto de partida para un plan de manejo que hace parte de la Universidad Libre Seccional Pereira Sede Belmonte, en el sendero del campus universitario. La metodología las metodologías utilizadas fueron adaptadas de las propuestas por IDEAM, resaltando además que las muestras fueron tomadas en época de lluvia; en este sentido se realizaron pruebas microbiológicas como determinación de E. coli y algunos parásitos, además de pruebas fisicoquímicas como DBO, Demanda química de oxígeno, se determinó sólidos totales y el método soxhlet en grasas y aceites.